《使徒行者2：谍影行动》谁是卧底不重要，敢在香港闹事就不行！

2016年的电影版《使徒行者》算是给了TVB同名电视剧粉丝们一个交代，但是，3年后的续集《使徒行者2》不再是TVB剧版《使徒行者2》的延续。导演文伟鸿和编剧关皓月围绕着兄弟情谊、双重身份、忠诚与背叛的相似主题制作了一个全新的故事，同时保留了第一部包括张家辉、古天乐和吴镇宇在内明星云集的演员阵容。事实上，这部续集只是沿用了前一部的片名，其本身是一部更加扣人心弦、辛酸感人、惊险刺激的电影。
在这部续集中，吴镇宇和张家辉分别饰演刑事情报科反恐部门警司叶国帆和总督察程滔，负责调查在尖沙咀发生的一起疑似恐怖袭击事件——一辆汽车在光天化日之下冲撞行人，随后司机割颈而死。很快他们盯上了独立记者姚可仪（姜珮瑶饰），在撞人事件即将发生之前她曾报警预告。叶国帆和程滔跟踪姚可仪，还从一个想绑架她的蒙面杀手中解救了她。

可惜，随后的审讯被突然出现的保安部警司井进贤（古天乐饰）打断，他自称已获得警务处处长（马德钟饰）授权接管该案件。不过，在此之前姚可仪已经透露，在追踪贩卖人口的新闻线索时，她和同事偶然发现了一个强大的恐怖组织，该组织绑架儿童，将他们训练成外勤特工，并利用这些特工渗透到世界各地的警察组织中，其中就包括香港警察。
从那一刻起，影片就开始明确暗示，叶国帆、程滔和井进贤都有可能在为这个恐怖组织效力；而且开场序幕已经揭示，这三个人中有一个小时候名叫奀仔，原本住在菲律宾的一个乡村孤儿院里，在1987年被这个组织绑架了。同时开场序幕也暗示了，这三个人中有一个是奀仔小时候的好朋友阿Dee。原本阿Dee才是绑架者的目标，但奀仔回来救了他，结果自己反而被绑走了。而现在三人之间的关系更加复杂化，原来叶国帆一直是程滔和井进贤的入行师傅，尽管后两者彼此不信任，但叶国帆相信他们两个都是清白的。